Op 25 april 1950 wordt in Ambon de onafhankelijke Republiek der Zuid-Molukken RMS) geproclameerd. Dit is een reactie op de omvorming van de federatieve Verenigde Staten van Indonesie (RIS) in een Indonesische eenheidstaat. De Indonesische leiders reageren aanvankelijk met een blokkade door de marine en veroveren uiteindelijk heel Ambon in december 1950. De RMS-regering en een deel van het RMS-leger ontsnapt naar het buureiland Seram. Daar wordt een guerrillastrijd gevoerd. Hieraan komt een einde als RMS-leider Chris Soumokil in december 1963 wordt gevangen genomen .In Nederland wordt een regering in ballingschap gevormd met ir. J.A. Manusama als president.